Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNAPINO95295 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms