Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CUBNO60494 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUBNO60494 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUBNO60494 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms