Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HTATSF1O43719 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms