Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTN4O43707 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN4O43707 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms