Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT7O43581 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SYT7O43581 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYT7O43581 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYT7O43581 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT7O43581 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT7O43581 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT7O43581 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYT7O43581 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms