Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms