Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms