Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNAP23O00161 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNAP23O00161 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms