Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C6orf229H3BNL8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C6orf229H3BNL8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms