Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms