Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A8MVJ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A8MVJ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A8MVJ9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
A8MVJ9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A8MVJ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms