Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRRM4A7MD48 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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