Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP27XA6NNY8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
USP27XA6NNY8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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