Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 VPS37A-208ENST00000521005 479 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SH3BP4Q9P0V3 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 AC024937.2-201ENST00000411669 1242 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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SH3BP4Q9P0V3 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SH3BP4Q9P0V3 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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