Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NT5C3A-201ENST00000242210 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC009237.9-201ENST00000414800 347 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC114752.2-201ENST00000424119 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL591379.2-201ENST00000450223 397 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC018475.1-201ENST00000478358 465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 GCSHP1-201ENST00000512554 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL118558.1-201ENST00000557551 566 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC026770.1-201ENST00000558994 581 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 LINC01989-201ENST00000566930 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SL14P-201ENST00000579715 298 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 AC023310.4-201ENST00000613130 650 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PDCD1Q15116 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms