Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
HOXD10P28358 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL353743.3-201ENST00000442109 1468 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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HOXD10P28358 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
HOXD10P28358 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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