Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 CD163-203ENST00000432237 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TMEM68-219ENST00000617977 4512 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 CRYAB-207ENST00000527950 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLD1P28340 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms