Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
MTSS1O43312 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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MTSS1O43312 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 ALKAL2-208ENST00000619265 496 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
MTSS1O43312 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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