Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
LAMB3Q13751 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
LAMB3Q13751 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms