Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC040978.1-201ENST00000617244 1282 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 EPHA5-201ENST00000273854 8266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 SRPK1-205ENST00000423325 4357 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 CNPY1-204ENST00000636446 1637 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 GPRASP2-201ENST00000332262 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 NOP2-202ENST00000382421 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 LMLN-202ENST00000332636 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TRHP20396 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL137145.1-201ENST00000391437 2447 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CDH26-201ENST00000244049 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 MEGF10-201ENST00000274473 7594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL137186.2-201ENST00000397264 3486 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 SPATA13-206ENST00000424834 8603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 WDFY2-201ENST00000298125 9321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 MAPK10-382ENST00000642023 2369 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 KLHL3-209ENST00000508657 6981 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC015920.1-201ENST00000624645 2450 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 SCML2-201ENST00000251900 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CCDC174-202ENST00000383794 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 FANCM-202ENST00000542564 6167 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 ACSL6-204ENST00000379244 2658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 IGBP1-AS1-201ENST00000366397 542 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 PRR32-201ENST00000371125 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 PROX1-AS1-203ENST00000451396 476 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 GAPDHP50-201ENST00000464421 993 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC084026.2-201ENST00000521101 642 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 LINC02280-201ENST00000564585 3816 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 RN7SL426P-201ENST00000579106 295 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CACNB2-216ENST00000617363 4385 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC007848.2-201ENST00000543308 1727 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 TCF4-211ENST00000561992 2184 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 POLH-202ENST00000372236 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 HLA-F-AS1-209ENST00000458236 2835 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 SOCS4-202ENST00000395472 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 ZNF80-202ENST00000482457 2471 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 ZSCAN30-205ENST00000589178 3368 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRHP20396 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 SET-204ENST00000372692 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 KCTD19-201ENST00000304372 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 KCNE1-204ENST00000399289 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 PRNT-203ENST00000423718 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 ACOXL-AS1-201ENST00000376593 3026 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 KCNA2-203ENST00000485317 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 MED12-201ENST00000333646 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 ADGRE1-205ENST00000450315 2567 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 LINC00578-202ENST00000442937 612 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
TRHP20396 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms