Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNA5SP71-201ENST00000362967 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092952.1-201ENST00000397646 1209 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01508-202ENST00000436671 755 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF195-208ENST00000438262 1018 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SL414P-201ENST00000469545 294 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 IGKV1-39-201ENST00000498574 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02059-201ENST00000503843 452 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP000907.3-201ENST00000530733 322 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR7E96P-201ENST00000530816 976 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC005479.1-201ENST00000554629 451 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL357093.2-202ENST00000556942 498 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC063923.2-201ENST00000562158 928 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms