Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SMCO2-201ENST00000298876 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 COQ3-202ENST00000369240 646 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GSTM1-203ENST00000369819 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRAJ24-201ENST00000390513 63 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SMCO2-202ENST00000416383 1272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL354732.1-204ENST00000421020 755 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC114550.1-201ENST00000518846 573 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC027808.2-203ENST00000558261 638 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC011444.4-201ENST00000586415 418 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC007221.2-201ENST00000634367 948 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MEF2C-221ENST00000514015 2772 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC116351.1-201ENST00000399869 3482 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OAS2-207ENST00000620097 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP161-201ENST00000363871 115 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP55-201ENST00000423136 803 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC005077.3-202ENST00000437494 300 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC00578-201ENST00000439009 542 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL135929.1-201ENST00000449287 552 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PDPN-205ENST00000487038 607 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NACA2-201ENST00000521764 777 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PRPSAP2-217ENST00000542013 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PSEN1-223ENST00000557511 1230 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms