Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 NQO1-204ENST00000439109 924 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPL3P10-201ENST00000476002 1164 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 RN7SL464P-201ENST00000492743 297 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC091805.1-201ENST00000498395 342 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 MYOM1-203ENST00000400569 4927 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 THAP5-203ENST00000415914 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 ASB15-202ENST00000434204 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 MAP3K7CL-201ENST00000286791 1725 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 DDX11-201ENST00000228264 3717 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 MEP1B-204ENST00000581447 2308 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01426-202ENST00000420877 2632 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 NRG3-204ENST00000404576 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 CHST4-201ENST00000338482 2412 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
TRHP20396 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 SP4-201ENST00000222584 6126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 SELENOP-209ENST00000511224 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 MAGEB16-202ENST00000399987 1736 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 WISP3-204ENST00000368666 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 SEMA4D-207ENST00000420987 4275 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 TNR-IT1-201ENST00000455447 630 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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TRHP20396 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC02289-202ENST00000556781 861 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 TPP1-201ENST00000299427 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 LRRC15-202ENST00000428839 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 HDLBP-201ENST00000310931 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 B3GALT5-201ENST00000343118 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 SLC6A12-201ENST00000359674 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 KIAA1328-207ENST00000591619 5881 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 NTRK3-221ENST00000629765 2714 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TRHP20396 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 TMEM196-201ENST00000405764 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 DMD-206ENST00000361471 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 MSANTD3-TMEFF1-201ENST00000502978 2069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC026250.1-201ENST00000500698 2311 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 MAP4-205ENST00000420772 3478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 OARD1-210ENST00000479950 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 RN7SKP173-201ENST00000362821 315 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 RN7SKP48-201ENST00000365031 328 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TRHP20396 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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