Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SLC14A1-201ENST00000321925 3971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 IGKV3-15-201ENST00000390252 442 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 Z99758.1-201ENST00000432081 368 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC002066.1-202ENST00000439070 699 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC098828.2-201ENST00000452342 573 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 C11orf70-202ENST00000526781 845 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CRADD-211ENST00000552983 839 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC074135.1-201ENST00000594318 581 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 MIR205HG-210ENST00000603283 455 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC006547.1-211ENST00000609191 828 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RN7SL3-201ENST00000610674 299 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AC093495.1-212ENST00000630173 1162 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
VPREB1P12018 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms