Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC090912.1-201ENST00000578831 570 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 JPT1-211ENST00000581874 517 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL121917.2-201ENST00000605044 390 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MED15P6-202ENST00000621415 787 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00662-203ENST00000586954 2254 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SCOC-AS1-201ENST00000512692 1987 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PIGN-221ENST00000638183 4046 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCNYL3-201ENST00000407030 998 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RANP5-201ENST00000427731 655 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ARL2BPP7-201ENST00000446421 490 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL854P-201ENST00000459767 295 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL862P-201ENST00000491550 298 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CC2D2A-205ENST00000503658 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AL132719.1-201ENST00000554515 423 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 APOOP5-202ENST00000564761 566 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR1P1-201ENST00000571766 994 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC087393.2-201ENST00000580962 504 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC073488.5-201ENST00000631993 754 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 GSTM2-204ENST00000369831 1730 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01091-204ENST00000515769 2204 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-296ENST00000641283 2826 ntAPPRIS P2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SLC13A3-202ENST00000290317 3994 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM5-208ENST00000615021 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms