Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 RN7SKP77-201ENST00000363261 353 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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COL4A5P29400 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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COL4A5P29400 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
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COL4A5P29400 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
COL4A5P29400 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
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COL4A5P29400 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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COL4A5P29400 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 MYO1E-201ENST00000288235 8673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
COL4A5P29400 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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