Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 KLRD1-203ENST00000350274 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 SUMO2P10-201ENST00000452006 288 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC00501-201ENST00000425388 2046 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ATXN1-201ENST00000244769 10602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC02179-201ENST00000561523 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RNF152-201ENST00000312828 9501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 UBXN10-201ENST00000375099 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
PTPRMP28827 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms