Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
HDDC3Q8N4P3 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL392046.1-201ENST00000450742 569 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
HDDC3Q8N4P3 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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