Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP426-201ENST00000362901 121 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TTI1-201ENST00000373447 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL031733.1-201ENST00000422817 455 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ASS1P5-201ENST00000435496 1239 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LYSMD1-202ENST00000440902 1003 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL136454.1-201ENST00000443181 466 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL218P-201ENST00000464637 299 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MYADML-203ENST00000491596 951 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PSAT1P1-201ENST00000518968 1106 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01499-201ENST00000528720 553 ntTSL 4 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J2-203ENST00000394186 305 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC017104.2-201ENST00000417000 321 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A4-AS1-201ENST00000426459 795 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL5P17-201ENST00000469685 877 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL17P37-201ENST00000490729 548 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL031864.2-201ENST00000498507 350 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms