Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 ERG-205ENST00000398910 4954 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
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TCOF1Q13428 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
TCOF1Q13428 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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TCOF1Q13428 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
TCOF1Q13428 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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