Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 NEK2P4-201ENST00000425793 1329 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 IAPP-205ENST00000542023 2015 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CTXN3Q4LDR2 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms