Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL139100.1-201ENST00000408001 498 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MIR3159-201ENST00000584572 74 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL592430.1-202ENST00000414383 1546 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 MTND1P10-201ENST00000426108 832 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
RTL8BQ17RB0 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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