Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 HIPK1-204ENST00000369555 3966 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LIPA-203ENST00000371837 2513 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC007278.1-201ENST00000450893 1327 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CDH18Q13634 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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