Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC020611.2-201ENST00000535594 671 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CDY10P-201ENST00000452415 1567 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
ACADSBP45954 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms