Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 BOLL-204ENST00000430004 2987 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TMC5-208ENST00000564959 2434 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC00269-201ENST00000399711 2173 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.8 ms