Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ADNP-204ENST00000396032 4581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 USP28-201ENST00000003302 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC26A9-203ENST00000367135 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 ZWINT-201ENST00000318387 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RBMS2-207ENST00000552247 1471 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 VOPP1-208ENST00000433959 2900 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CD22-204ENST00000536635 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A13-201ENST00000311856 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC22A6-201ENST00000360421 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MAGEB4-201ENST00000378982 2142 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SEMA4A-202ENST00000368282 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 RASGRP4-217ENST00000615439 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 CHEK2-208ENST00000404276 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
ATXN8OSP0DMR3 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC02145-202ENST00000507444 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC008507.5-201ENST00000624591 1969 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CLVS2-201ENST00000275162 11485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ANO1-209ENST00000531349 3552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC009948.1-205ENST00000453026 2007 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 USF1-201ENST00000368019 998 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SALL4-202ENST00000371539 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GHRH-202ENST00000373611 377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PROSER3-203ENST00000421853 650 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 GAPDHP54-201ENST00000432657 893 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC019080.2-201ENST00000453859 394 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RPL34P17-201ENST00000472160 347 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CYB5RL-207ENST00000497820 679 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC025171.2-202ENST00000505541 402 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPA3-201ENST00000526520 954 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPA2-202ENST00000530328 954 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 NPIPA5-202ENST00000534094 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 OR4D7P-201ENST00000534196 942 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 FOXC2-AS1-201ENST00000563280 319 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC018943.1-202ENST00000569137 399 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC091062.1-201ENST00000572491 457 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR4327-201ENST00000581194 85 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 Metazoa_SRP.72-201ENST00000617458 278 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC009133.4-201ENST00000619159 561 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC073107.2-201ENST00000620476 238 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MIR6876-201ENST00000622618 73 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL136526.1-201ENST00000624456 2203 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 B3GALNT1-201ENST00000320474 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 PPIG-202ENST00000409714 2615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CD22-203ENST00000419549 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ZNF608-203ENST00000504926 4726 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 STX17-201ENST00000259400 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 TRIM43-201ENST00000272395 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AL031663.3-201ENST00000617473 1794 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MX2-201ENST00000330714 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LINC01719-204ENST00000611275 2054 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 THADA-206ENST00000405006 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 F11-203ENST00000403665 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 ITGB6-205ENST00000428609 2576 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 SIGLEC10-206ENST00000441969 2768 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MYH15-201ENST00000273353 7074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BACH2-201ENST00000257749 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 BHLHB9-201ENST00000361229 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 LMOD1-201ENST00000367288 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX1-202ENST00000340209 4099 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 CACNB2-216ENST00000617363 4385 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 HACL1-207ENST00000451445 1734 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 AC008937.3-201ENST00000606813 1700 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ATXN8OSP0DMR3 MRPL45-203ENST00000613675 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms