Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 SNHG14-217ENST00000552781 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL358394.2-201ENST00000427229 3637 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 EEF1A1P20-201ENST00000514852 1386 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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NKD2Q969F2 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC092435.1-202ENST00000512752 518 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NKD2Q969F2 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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