Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MTFR1L-207ENST00000466284 3262 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM71Q2Q1W2 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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