Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC108136.1-201ENST00000530350 631 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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CDH18Q13634 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CDH18Q13634 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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