Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL009031.1-202ENST00000632370 886 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC018793.5-201ENST00000640302 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 IGFL2-201ENST00000377693 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL596451.1-201ENST00000419824 572 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL121917.1-202ENST00000424434 367 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PRPS1P2-201ENST00000430496 937 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL135933.1-201ENST00000498657 802 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC226119.1-201ENST00000514073 682 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LALBA-202ENST00000549817 1243 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC009063.2-201ENST00000563981 906 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RN7SL689P-201ENST00000577215 297 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC097717.1-227ENST00000594069 1322 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ADK-201ENST00000286621 1169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 PARD3-AS1-201ENST00000446211 302 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AL928654.1-201ENST00000476081 354 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 AC068205.2-201ENST00000532864 771 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
IFFO1Q0D2I5 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms