Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms