Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIR744-201ENST00000578242 98 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL731661.2-201ENST00000448824 806 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
HOXD13P35453 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms