Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
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HOXD10P28358 MLIP-201ENST00000274897 1815 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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HOXD10P28358 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
HOXD10P28358 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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