Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ADGRA3-209ENST00000508133 1572 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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USP18Q9UMW8 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP18Q9UMW8 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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