Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SGMS1-201ENST00000361543 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DCN-207ENST00000546370 586 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 U47924.1-201ENST00000606539 434 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL391425.1-201ENST00000613658 807 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC233280.20-201ENST00000637412 416 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 BCAS3-234ENST00000639611 108 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC083864.3-202ENST00000570271 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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