Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TAPT1-AS1-201ENST00000570786 2165 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 CD36-214ENST00000447544 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 GAB3-202ENST00000369575 4718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 KRT18P52-201ENST00000404956 846 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 LINC00385-201ENST00000435044 374 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 ST13P18-201ENST00000456632 1027 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC079384.1-201ENST00000548506 600 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 DIO2-211ENST00000557125 517 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL139020.1-203ENST00000556386 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 CAST-244ENST00000515663 1473 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 TOM1L1-203ENST00000536554 1522 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 DNAJC27-AS1-205ENST00000434897 4660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC007923.2-201ENST00000584218 1591 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 GSG1-203ENST00000396302 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 IFT46-201ENST00000264020 1819 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 OR4D2-202ENST00000641866 2011 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL592158.1-201ENST00000632210 4477 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 TRO-204ENST00000375041 3488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL137784.1-201ENST00000407121 745 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC093616.1-201ENST00000427434 2095 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 DDX11L10-201ENST00000430178 571 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 ZNF410-205ENST00000442160 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 RN7SL761P-201ENST00000463259 278 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 FBN2-203ENST00000507835 1884 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL356019.2-201ENST00000556738 3829 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 MIR4518-201ENST00000580665 83 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 KDM5D-210ENST00000541639 5579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 BIVM-ERCC5-204ENST00000639132 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 ZEB2-234ENST00000636413 8984 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 METTL15-204ENST00000407364 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TRHP20396 PGRMC2-202ENST00000394276 2858 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms