Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RHOJ-201ENST00000316754 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNX19-202ENST00000426933 888 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL606804.1-201ENST00000435333 538 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC01053-201ENST00000457628 771 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SSX8-201ENST00000506270 579 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KLRD1-210ENST00000543777 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 DRAIC-206ENST00000559029 309 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RN7SL178P-201ENST00000582930 304 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HNF4A-AS1-202ENST00000609152 413 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MIR6731-201ENST00000614863 72 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL445250.1-203ENST00000641829 1535 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CDH18-201ENST00000274170 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZNF426-201ENST00000253115 7085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MEF2C-217ENST00000510942 3446 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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