Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PIK3CB-208ENST00000477593 4658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 HP1BP3-203ENST00000375003 4822 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01772-201ENST00000457898 3245 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SOS2-202ENST00000543680 3960 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR1C1-201ENST00000408896 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC012462.2-201ENST00000414756 391 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
E2F1Q01094 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms