Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC093752.1-213ENST00000503038 2376 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 GRIK1-AS1-202ENST00000412579 818 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC139713.2-212ENST00000506982 832 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LDHC-204ENST00000536880 957 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RNF7Q9UBF6 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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