Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 GEMIN2P2-201ENST00000418195 715 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC096708.2-201ENST00000577676 512 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC012358.3-204ENST00000599475 978 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CYP2G2P-201ENST00000594920 1485 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC011498.1-203ENST00000589066 359 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms